Der nicht gefährdete Totenkopfaffe ist wegen seiner Kopfzeichnung und seines Verhaltens eine beim Publikum ausgesprochen beliebte Tierart und eignet sich daher bestens als Botschafter für den Schutz des südamerikanischen Tropenwalds. Gefördert durch ein Erhaltungszuchtprogramm ist er in europäischen Zoos sehr häufig anzutreffen.
In den Gruppen der Bolivianischen Totenkopfaffen leben viele Weibchen und Männchen zusammen. Bei beiden Geschlechtern gibt es eine Rangordnung. Während bei den Männchen der Stärkste die anderen dominiert, hat bei den Weibchen die stärkste Frauengruppe das Sagen. Sie dominiert über die Weibchengruppen und über die Männchen.